Ikari Gendo đã chết. Người đàn ông luôn đứng sau màn giật dây này đã chết. Không còn ông ta, kế hoạch Bổ hoàn nhân loại (Human Instrumentality Project) trực tiếp rơi vào bế tắc. Nhưng đó vẫn chưa phải là điều quan trọng nhất, điều quan trọng nhất chính là ông ta là cha của nhân vật chính, là người chồng duy nhất trong linh hồn ẩn giấu của Sơ Hào Cơ, cũng là người mà Ayanami Rei quan tâm nhất, càng là người thực thi kế hoạch Bổ hoàn nhân loại.
Hàng loạt thân phận trên người ông ta khiến cái chết này như một quả bom nguyên tử bị kích nổ. Cơn phong ba bão táp ấy chỉ trong vòng một giờ ngắn ngủi đã càn quét khắp toàn thế giới. Và không một ai để ý rằng, Adam đã biến mất, Nagisa Kaworu cũng biến mất.
Adam và Nagisa Kaworu biến mất đang ở đâu? Lúc này, gã đã xách chiếc hộp chứa Adam đi vòng qua khu vực giáo điều trung tâm, tiến vào tầng sâu nhất, đến trước mặt Lilith đang bị đóng đinh trên thập tự giá.
Mục đích Nagisa Kaworu đến đây chính là giải phóng Lilith, dung hợp với cựu khu, thành tựu vĩnh hằng để đón chào kỷ nguyên mới. Và một khi gã thành công, Tam đại xung kích (Third Impact) sẽ ập đến, khi đó toàn bộ sự sống trên Trái Đất sẽ biến mất.
Chính vì sự thay đổi mãnh liệt này, hệ thống mới gia tăng sản lượng năng lượng, nâng tốc độ xâm nhập lên một bậc nữa. Lúc này mức độ hệ thống xâm nhập thế giới này đã đạt tới tám mươi phần trăm, nghĩa là ngoài khu vực cốt lõi nhất ra, phần lớn thế giới này đều đang nằm trong tầm kiểm soát của nó.
"Nói cách khác, tiếp theo chỉ cần toàn lực công chiếm cốt lõi của thế giới này, giành lấy quyền kiểm soát, thì thế giới này sẽ thuộc về ta, có đúng không?" Diệp Vân đứng trước cửa sổ, nhìn mặt trời dần xế bóng, chậm rãi nói.
"Đúng vậy, nhưng do cốt lõi tức là Thiên Đạo pháp tắc vẫn đang nằm dưới sự kiểm soát của ý chí thế giới này, nên một khi nó phát hiện ra bất thường, vẫn có khả năng tự bạo để hủy diệt thế giới này." Lời của hệ thống khiến sự phấn khích trong lòng Diệp Vân giảm bớt đôi chút, nhưng trên mặt gã vẫn treo nụ cười rạng rỡ.
Diệp Vân suy nghĩ một chút, nói: "Vậy thì đẩy nhanh tốc độ xâm nhập, trước tiên khiến nó không thể tự bạo thế giới này. Đến lúc đó dù bị phát hiện, cùng lắm chỉ chịu chút tổn thất, nhưng chúng ta vẫn có thể chiếm lấy thế giới này. Ta không muốn đổ sông đổ biển nhiều năng lượng như vậy."
Hệ thống không trả lời Diệp Vân, nhưng Diệp Vân lại cảm thấy một chút choáng váng nhẹ, nghĩ là hệ thống lại gia tăng sản lượng năng lượng. Mà Diệp Vân với tư cách là vật chủ của hệ thống, dù số năng lượng này không phải dùng từ người gã, nhưng cũng phải thông qua cơ thể gã làm đường dẫn, nên gã cảm thấy đôi chút khó chịu.
Diệp Vân hiểu rõ, đây là cơ thể mình sắp đạt tới giới hạn rồi. Nếu sản lượng năng lượng còn tăng nhanh nữa, cơ thể gã có khả năng sẽ chịu tổn thương. Vì vậy, gã vội vàng bố trí kết giới trong phòng rồi khoanh chân ngồi xuống. Gã phải điều chỉnh trạng thái, để bản thân luôn ở trạng thái tốt nhất mới được.
Khi Diệp Vân khoanh chân ngồi xuống, tầng sâu nhất của Đệ tam Đông Kinh thị cũng diễn ra đại chiến kịch liệt. Nagisa Kaworu dung hợp với cựu khu trở nên to lớn vô cùng, hơn nữa trên đỉnh đầu vì tích tụ năng lượng mà sinh ra một vòng hào quang tương tự như vòng sáng trên đầu thiên sứ. Một khi gã mọc ra đôi cánh và rút cây thương Longinus đang cắm trên người Lilith ra, Tam đại xung kích sẽ ập đến. Thế là toàn bộ EVA đều xuất động, kéo đến ngăn cản Nagisa Kaworu rút thương Longinus.
Tuy nhiên, hai bên đang chiến đấu trên mặt đất đều không để ý rằng, vốn dĩ chỉ mới là lúc hoàng hôn, mặt trời vẫn chưa lặn, nhưng lúc này bầu trời đã trở nên đỏ rực, giống như những đám mây trên trời thực sự đang bốc cháy vậy.
"Ầm!"
Dù là EVA hay Sứ đồ, một khi hai bên giao chiến thì sức tàn phá đều vô cùng lớn, huống hồ còn là Adam đã dung hợp lại với cựu khu. Vì thế chẳng mấy chốc, Asuka và những người khác đã bị đánh bại, chỉ còn lại Ikari Shinji cùng Sơ Hào Cơ của cậu ta vẫn đang kiên trì.
"Shinji, không ngờ có một ngày ta lại trở thành kẻ địch. Nhưng đừng trách ta, phải trách thì trách cha ngươi ấy. Nếu không phải ông ta, ta cũng sẽ không trở thành bộ dạng như bây giờ. Nhưng giờ nói gì cũng muộn rồi, Shinji, bây giờ hãy để chúng ta quyết một trận tử chiến đi!"
Lời của Nagisa Kaworu vừa dứt, hai bên lại va chạm vào nhau. Mà vì Ayanami Rei và Asuka bị đánh bại, tính mạng đang trong tình thế nguy nan, lại biết được cha mình chết trong tay Nagisa Kaworu, Ikari Shinji phát điên rồi.
Sự điên cuồng của Ikari Shinji tương ứng với Sơ Hào Cơ chính là "bạo tẩu". Sơ Hào Cơ lại bạo tẩu lần nữa, và lần bạo tẩu này không còn là sự bạo tẩu đơn phương của Sơ Hào Cơ, rơi vào trạng thái hỗn loạn vô ý thức nữa. Lần bạo tẩu này, ý thức của Ikari Shinji vẫn tỉnh táo, cậu vẫn có thể điều khiển Sơ Hào Cơ, hơn nữa tỷ lệ đồng bộ giữa cậu và Sơ Hào Cơ đã đạt tới bốn trăm phần trăm.
Tỷ lệ đồng bộ bốn trăm phần trăm đại diện cho điều gì? Tỷ lệ đồng bộ bốn trăm phần trăm đại diện cho việc cơ thể Ikari Shinji đã tan chảy trong LCL, triệt để hòa làm một với Sơ Hào Cơ, cũng giống như mẹ cậu lúc trước vậy.
Ikari Shinji triệt để hòa làm một với Sơ Hào Cơ đã thực sự phát huy ra thực lực của EVA. AT trường (AT Field) cuồng bạo và dâng trào ào ạt tuôn ra. Sau đó vì năng lượng quá lớn, trên đỉnh đầu Sơ Hào Cơ cũng xuất hiện một vòng hào quang.
Tại bộ chỉ huy, Katsuragi Misato và những người khác nhìn thấy cảnh tượng trước mắt, trên mặt lộ ra nụ cười đắng chát. Vòng hào quang này đại diện cho điều gì, những người trong cuộc như họ đều hiểu. Mà một vòng hào quang đã đủ chết người rồi, giờ lại xuất hiện hai cái. Có nghĩa là, nếu không có gì bất ngờ, sự ập đến của Tam đại xung kích đã không thể tránh khỏi. Bởi vì dù ai sống ai bại, kẻ thắng sẽ thành thần, rồi sức mạnh khổng lồ đó sẽ gây ra xung kích mãnh liệt, sẽ giết chết tất cả những sinh vật còn sót lại.
Trận chiến bên phía Ikari Shinji bước vào thời khắc mấu chốt, bên phía Diệp Vân cũng đi tới thời khắc mấu chốt. Hệ thống thực thi nghiêm ngặt suy nghĩ của Diệp Vân, sau đó sự xâm nhập của hệ thống đã bị phát hiện. Tuy nhiên, ý chí thế giới phát hiện hơi muộn, lúc này nó đã không thể hủy diệt toàn bộ thế giới được nữa. Hiện tại nó chỉ có thể liều mạng chống cự sự xâm nhập của hệ thống, phải đuổi hệ thống ra khỏi khu vực cốt lõi mới có thể tự bạo vũ trụ này, khiến hệ thống không thể đắc thủ.
Tình huống hiện tại, thế giới này có thể nói đã có chín mươi chín phần trăm thuộc về bọn họ rồi. Tiếp theo chỉ cần tiêu hao lượng lớn năng lượng, rồi tốn thời gian từ từ mài là được. Tuy nhiên, Diệp Vân cũng đã trả giá rất lớn.
Hệ thống tuy trong thời gian ngắn đã xâm nhập bạo lực vào cốt lõi của thế giới này, đạt được mục đích Diệp Vân đã nói trước đó, nhưng Diệp Vân cũng vì sản lượng năng lượng không ngừng tăng cao mà cơ thể cũng xuất hiện tổn thương. Lúc này trên cơ thể gã đã xuất hiện không ít vết thương li ti, quần áo trên người đều đã bị máu rỉ ra nhuộm đỏ, hơn nữa lúc này năng lượng của hệ thống cũng chỉ còn lại hơn bốn mươi phần trăm một chút.
Diệp Vân kiểm tra vết thương trên người mình, nhìn lại lượng năng lượng còn lại của hệ thống, cười khổ: "Theo tình huống hiện tại, thế giới này dù có chiếm được, năng lượng của chúng ta nhiều nhất cũng chỉ còn mười phần trăm, tổn thất nặng nề a. Sớm biết sẽ như thế này, vẫn nên an toàn một chút thì hơn. Tuy nhiên, đáng."
Chữ "đáng" của Diệp Vân vừa dứt, một cơn choáng váng dữ dội đột nhiên ập tới, khiến gã không kìm được khí huyết quay cuồng, phun mạnh ra một ngụm máu tươi. Tuy nhiên chuyện này vẫn chưa xong, gã vừa phun máu xong, một uy áp mạnh mẽ ập tới che trời lấp đất liền giáng xuống người gã, mà trận pháp phòng ngự gã bố trí giống như bong bóng vậy, trực tiếp bị chọc thủng, thậm chí không hề phát huy chút tác dụng chống đỡ nào.