Trong lúc những người khác đang khẩn trương lắp ráp mạch điện để kết nối với Positron Cannon (Pháo Positron), Minh Yên Vi đã lái Zero số 0 đi từ đường hầm được dọn dẹp riêng tiến về phía nơi Sứ đồ đang ở trên đỉnh đầu. Có lẽ vì Sứ đồ đang bận khoan hầm, nên mãi đến khi Minh Yên Vi lên đến mặt đất, nó mới phát hiện ra cô.
Ngay khoảnh khắc phát hiện Zero số 0, Sứ đồ thứ năm liền phát động tấn công. Thế nhưng, Minh Yên Vi không phải là Ikari Shinji, cô sẽ không đứng yên tại chỗ chịu đòn. Ngay trước giây phút tia sáng của Sứ đồ phát ra, Minh Yên Vi đã điều khiển cỗ máy lăn một vòng tại chỗ, không những né được đòn tấn công mà còn tiến thêm được một khoảng cách.
Trong quá trình lăn, Minh Yên Vi điều chỉnh công suất AT Field của Zero số 0 lên mức tối đa, trực tiếp làm tan rã AT Field đang phòng ngự xung quanh nó. Khi Minh Yên Vi điều khiển Zero số 0 đứng dậy, thanh cự kiếm dài bốn mươi mét sau lưng cỗ máy đã nằm gọn trong tay.
AT Field đã tan rã, hiện giờ cô chỉ cách Sứ đồ thứ năm hơn một thân người, cộng thêm cái mũi khoan mà tên Sứ đồ này thò ra đã cắm sâu vào lòng đất của Tokyo-3, nên nó muốn né tránh cũng không được.
Khoảng cách gần như vậy, đừng nói là Minh Yên Vi, ngay cả người khác cũng thế, nhắm mắt cũng có thể chém trúng. Thế là một cảnh tượng cực kỳ giống với lần trước lại xuất hiện, Sứ đồ thứ năm không còn sự bảo vệ của AT Field đã bị Minh Yên Vi chém một kiếm đứt đôi cùng với phần lõi, đồng thời cắt đứt luôn đòn tấn công mà nó đã tích tụ được một nửa.
Sau khi chém đôi Sứ đồ thứ năm, Minh Yên Vi không dừng lại, trực tiếp nhảy lùi về sau, không chút do dự chui trở lại vào đường hầm. Ngay khoảnh khắc Minh Yên Vi lái Zero số 0 quay trở lại đường hầm, Sứ đồ thứ năm phát ra tiếng kêu thảm thiết, ngay sau đó phần lõi đột nhiên biến thành chất lỏng màu đỏ rồi nổ tung, cuối cùng toàn bộ cơ thể khổng lồ hình thoi biến thành một vũng chất lỏng màu đỏ.
Người trong trung tâm chỉ huy nhìn thấy cảnh này đều ngẩn cả người, họ không ngờ Minh Yên Vi lại hoàn thành nhiệm vụ xuất sắc đến vậy, giải quyết Sứ đồ thứ năm một cách gọn gàng dứt khoát. Nhưng dù sao thì đây cũng là chuyện tốt.
Minh Yên Vi giải quyết xong Sứ đồ thứ năm trở về liền nhận được sự tán dương của mọi người. Ánh mắt những người khác nhìn về phía Diệp Vân cũng tràn đầy sự thán phục, rồi... rồi Diệp Vân bị Katsuragi Misato gọi vào văn phòng của cô.
Katsuragi Misato dẫn Diệp Vân vừa vào văn phòng liền lên tiếng nói thẳng: "Diệp Vân, tôi biết thực lực và năng lực của cậu đều rất khá, nhưng chuyện này liên quan đến sự an nguy của cả thế giới, sơ sẩy một chút thôi là có thể khiến cả thế giới này tiêu tùng. Chúng ta không thể mạo hiểm quá mức, nên tôi hy vọng cậu có thể hiểu cho tôi."
Diệp Vân gật đầu, đáp: "Tôi hiểu. Nhưng tôi tin vào phán đoán của mình, sau này nếu lại xuất hiện tình huống như thế, tôi vẫn sẽ đứng ra. Chúng ta không thể gửi gắm toàn bộ hy vọng lên người một kẻ duy nhất, nhưng tôi sẽ bàn bạc trước với Chỉ huy một tiếng."
Katsuragi Misato nghe thấy câu trả lời này của Diệp Vân liền hài lòng gật đầu, ra hiệu cho Diệp Vân có thể rời đi. Sau khi Diệp Vân đi khỏi, Katsuragi Misato nhìn cánh cửa đã đóng lại, lộ ra vẻ đăm chiêu, lẩm bẩm: "Không thể gửi gắm tất cả hy vọng lên người một người sao? Có lẽ cậu nói đúng."
Diệp Vân không hề biết rằng vì lời nói của mình mà suy nghĩ trong lòng Katsuragi Misato đã lặng lẽ thay đổi. Cô không còn đặt tất cả hy vọng vào Ikari Shinji nữa. Tuy nhiên, việc cô đặt hy vọng vào ai thực ra cũng chẳng khác biệt gì, bởi vì thế giới này đã định sẵn là sẽ không còn đi theo quỹ đạo ban đầu nữa.
Những ngày sau đó, mặc dù vì sự nhúng tay của Diệp Vân và Minh Yên Vi khiến cốt truyện thay đổi, Ikari Shinji không còn rời đi sau khi đánh bại Sứ đồ thứ tư như trong nguyên tác, cậu vẫn tiếp tục tiếp nhận sự huấn luyện của Diệp Vân, bao gồm cả Ayanami Rei.
Vì Minh Yên Vi tạm thời thay thế vị trí của Ayanami Rei nên cô không cần phải ra trận. Hiện tại vết thương trên người Ayanami Rei đã hoàn toàn hồi phục, nên ngoài việc đi học ra, cô cũng cùng Ikari Shinji tiếp nhận sự huấn luyện của Diệp Vân.
Những ngày như vậy kéo dài được hơn mười ngày thì cuối cùng cũng có thay đổi. Asuka và cỗ máy số 2 sắp cập bến Đảo quốc, họ phải đi tiếp đón. Và đi cùng hạm đội hộ tống còn có Kaji, chính là bạn trai cũ của Katsuragi Misato.
Thân phận này của ông ta không phải là điều Diệp Vân quan tâm, Diệp Vân quan tâm ông ta là vì lần này ông ta trở về còn mang theo một thứ, một thứ cực kỳ quan trọng trong Kế hoạch Bổ hoàn Nhân loại: nhục thể của Adam.
Nguyên bản khi Adam được phát hiện là một gã khổng lồ cao trăm mét với đôi cánh ánh sáng khổng lồ. Chấn động lần thứ nhất chính là vì Adam bị phát hiện mà gây ra, lúc đó cũng chẳng biết đã chết bao nhiêu người và động vật.
Sau Chấn động lần thứ nhất, nhân loại "thu hồi" Adam và khiến Adam thoái hóa, từ một gã khổng lồ cao trăm mét biến thành một phôi thai chỉ cần một chiếc vali là có thể xách đi. Và Kaji mang Adam đến là vì cha của Ikari Shinji là Ikari Gendo muốn cấy ghép Adam vào cơ thể mình.
Sở dĩ ông ta làm như vậy là vì vợ ông ta đã biến mất trong khoang lái khi một lần điều khiển cỗ máy số 1. Nhưng biến mất này không phải là bà ấy đã chết, mà là cơ thể bà ấy tan rã, linh hồn tiến vào trong lõi của cỗ máy số 1. Và khi cỗ máy số 1 có được Trái cấm Sự sống, chính là thời khắc bà ấy đạt được sự sống vĩnh hằng và thành thần.
Ikari Gendo cấy ghép Adam vào cơ thể mình thực ra cũng mang ý định tương tự, vì nguyện vọng duy nhất của ông ta là được gặp lại vợ mình. Nhưng vợ ông ta đã thành thần, nên muốn gặp lại bà ấy, bản thân ông ta phải thành thần, mà Adam chính là cơ hội để ông ta thành thần.
Tất nhiên, chỉ đơn thuần cấy ghép Adam vào cơ thể mình là không thể thành thần, vì Adam này chỉ là một cái vỏ mà thôi. Tuy nhiên ông ta đã tìm được linh hồn của Adam, mà linh hồn của Adam chính là Sứ đồ thứ 17, Nagisa Kaworu.
Nếu để Nagisa Kaworu chết vào một thời điểm thích hợp, thì linh hồn của cậu ta sẽ quay trở lại vỏ của Adam. Và khi linh hồn và vỏ của Adam hòa làm một, chính là lúc Ikari Gendo thành thần.
Trong nguyên tác Ikari Gendo có thành công hay không thì Diệp Vân không rõ, nhưng ông ta đúng là đã gặp lại vợ mình. Mà Diệp Vân quan tâm Kaji không phải là muốn cướp Adam, thực ra hắn chỉ muốn lấy chút mẫu vật mà thôi.
Ikari Gendo không biết Diệp Vân đã để mắt tới thứ mà ông ta quyết giành lấy là Adam. Tuy nhiên, mặc dù không phát hiện ra, nhưng vì cẩn thận, để kế hoạch không xảy ra sai sót, cũng để tránh kế hoạch xuất hiện thêm những biến số không thể lường trước, ông ta đã không để Minh Yên Vi tham gia vào công tác tiếp nhận cỗ máy số 2 và cỗ máy số 2 được vận chuyển tới riêng cho cô điều khiển, mà lấy lý do tăng cường huấn luyện để giữ cô lại cùng với Diệp Vân.
Ông ta làm vậy là vì Asuka là cô gái duy nhất trong số các phi công EVA trạc tuổi Ikari Shinji, mà sau khi Kế hoạch Bổ hoàn Nhân loại thành công thì cần có Adam và Lilith mới. Hiện tại Adam đã xác định là Ikari Shinji, vậy thì thân phận của Asuka cũng có thể đoán ra được.
Thế nhưng, liệu tất cả những điều này có thực sự diễn ra như Ikari Gendo dự đoán hay không?