Không lâu sau đó, các sứ giả từ quốc vương xứ Scythia tìm đến, mục đích là để xin lỗi về những sự việc đã xảy ra, đồng thời khẳng định rằng đó không phải là hành động của quốc gia Scythia mà là do một nhóm người khởi xướng với ý đồ cướp bóc kiểu như phường thảo khấu. Họ cũng cam đoan rằng quốc vương của mình sẵn lòng tuân lệnh những yêu cầu được đặt ra. Alexander gửi cho vị quốc vương này một lời hồi đáp lịch thiệp, bởi lẽ nếu tỏ ý nghi ngờ mà lại không thân chinh cầm quân tiến đánh thì thật chẳng vẻ vang gì, vả lại vào thời điểm đó, ông cũng chưa có cơ hội thuận tiện để làm việc này. Những người lính Macedonia đang trấn giữ thành trì ở Maracanda, khi bị Spitamenes và bè lũ của hắn tấn công, đã xông ra nghênh chiến, tiêu diệt một số kẻ địch và đẩy lùi toàn bộ số còn lại, rồi rút lui an toàn vào trong thành mà không chịu bất cứ tổn thất nào. Thế nhưng, khi Spitamenes hay tin đội quân do Alexander phái đến Maracanda đang tiến gần đến nơi, hắn liền giải vây cho thành và rút lui về kinh đô của Sogdiana. Pharnuches cùng các tướng lĩnh đi cùng, vì nôn nóng muốn tống khứ hắn hoàn toàn, đã bám đuổi theo khi hắn rút chạy về phía biên giới Sogdiana, rồi thiếu cân nhắc mà cùng nhau tấn công quân Scythia Du mục.

Lúc đó, Spitamenes vừa nhận được viện binh gồm 600 kỵ binh Scythia. Có thêm sự liên minh này, hắn càng thêm bạo dạn, quyết tâm đợi để nghênh chiến với đội quân Macedonia đang tiến tới. Hắn bố trí quân lính trên một vùng đất bằng phẳng gần sa mạc Scythia, không muốn chủ động tấn công cũng không muốn chờ đợi địch nhân, mà chỉ cưỡi ngựa xung quanh rồi bắn tên vào đội hình bộ binh phalanx. Khi lực lượng của Pharnuches lao tới, quân của Spitamenes dễ dàng tẩu thoát nhờ những con ngựa của chúng vào lúc đó nhanh nhẹn và sung sức hơn nhiều, trong khi kỵ binh của Andromachus đã kiệt quệ do hành quân liên miên và thiếu nguồn cỏ khô. Dù quân Macedonia dừng lại hay rút lui, quân Scythia vẫn không ngừng ép sát với toàn bộ sức lực. Nhiều người trong số đó bị trúng tên và một số đã tử trận. Vì vậy, họ quyết định dàn quân thành đội hình vuông và tiến về phía sông Polytimetus, bởi lẽ gần đó có một thung lũng nhiều cây cối, nhờ đó quân man di sẽ không còn dễ dàng bắn tên vào họ nữa, đồng thời bộ binh của họ cũng có thể phát huy tác dụng tốt hơn.

Thế nhưng, Caranus, chỉ huy kỵ binh, đã tự ý tìm cách vượt sông để đưa kỵ binh sang bờ bên kia lánh nạn mà không hề thông báo cho Andromachus. Đội bộ binh cũng theo sau mà chẳng nhận được bất kỳ mệnh lệnh nào; họ hoảng loạn lao xuống lòng sông dọc theo những bờ dốc đứng mà không hề có kỷ luật. Khi quân man di nhận thấy sai lầm của quân Macedonia, chúng liền nhảy xuống các khúc cạn ở khắp mọi nơi, cả người lẫn ngựa. Một số tên túm lấy những kẻ đã sang sông và đang chuẩn bị rút đi, giữ chặt lấy họ; số khác trấn giữ ngay trước mặt những kẻ đang lội xuống nước, xô ngã họ xuống sông; trong khi những tên khác thì bắn tên vào họ từ hai bên sườn; còn những tên khác nữa thì ập vào tấn công những người lính vừa mới bước xuống nước. Bị dồn vào thế bí tứ bề, quân Macedonia đành chạy lánh nạn sang một trong những hòn đảo nhỏ trên sông. Tại đó, họ hoàn toàn bị quân Scythia và kỵ binh của Spitamenes bao vây, tất cả đều bị bắn chết bằng tên, trừ một vài người bị chúng bắt làm nô lệ. Nhưng về sau, tất cả những người này cũng đều bị sát hại.